期刊论文：
⑫施悦琪,周童,余秀兰.匹配如何赋能：导生匹配度对博士生自主研究能力的影响机制研究[J].学位与研究生教育,2026,(02):69-75.CSSCI
⑪施悦琪，周童，余秀兰.“需求-氛围”匹配视角下博士生自主研究能力发展的影响因素分析[J].高等教育研究,2024,(10):64-73.CSSCI教育学权威
⑩施悦琪,谢鑫.激活与强化：博士生自主研究能力的形成机制研究[J].中国高教研究,2025,(01):66-74.CSSCI
⑨景安磊,周海涛,施悦琪.推进拔尖创新人才的一体化选育[J].教育研究,2024,45(04):17-27.CSSCI教育学Top
⑧施悦琪,周海涛.高校有组织科研的特征、模式与策略 [J]. 高等教育研究,2023,44(02):30-36. CSSCI教育学权威
⑦施悦琪.高等教育系统高质量发展的理论内涵与实践原则——自组织理论的视角[J].江苏高教,2022,(02):30-37.CSSCI
⑥施悦琪,周海涛.博士生自主研究能力的一个分析框架 [J]. 研究生教育研究,2022,(06):8-14.CSSCI
⑤施悦琪,钱蕾,张红霞. 美国一流大学本科专业设置与研究生专业关系初探——基于2015年卡内基分类数据库[J].江苏高教,2019,(08):119-124.CSSCI
④周海涛,施悦琪.高校价值治理的内涵、机制与策略[J].高等教育研究,2022,43 (06):13-20.CSSCI教育学权威.新华文摘纸质版（2023年第3期）转载
③周海涛,施悦琪. 促进共同富裕的高校育人创新路径[J].清华大学教育研究,2022,43(01):55-61. CSSCI.新华文摘纸质版（2022年第11期）、中国高等教育评估转载
②张红霞,施悦琪. 聚焦“科教融合”:“双一流”大学本科教育评估的应有之策 [J].江苏高教,2021,(06):15-24. CSSCI
①施悦琪. 非营利性民办学校组织属性定位的演进逻辑[J].现代教育管理,2022,(01):22-40.CSSCI
会议报告：
⑨“教育、科技、人才一体化与中国新时代研究生教育”第二届青年学者论坛（苏州，2026.4）
⑧2026 AERA Annual Meeting(美国洛杉矶.2026.4)
⑦第十一届“全国教育实证研究论坛”（上海.2025.11）分论坛报告
⑥中国学位与研究生教育学会研究生教育学专业委员会2025年度学术年会（厦门.2025.5）.分论坛报告
⑤中国高等教育学会高等教育学专业委员会2024年学术年会（广州.2024.11）分论坛报告
④第六届研究生教育研究生论坛.(北京.2023.11)分论坛报告
③第四届研究生教育研究生论坛(北京.2021.1)分论坛报告
②首届全国高校高等教育学研究生学术论坛(厦门.2018.10)大会报告
①2019高等教育国际论坛年会(兰州.2019.11)
科研项目：
⑤2024年全国社会科学基金项目（教育学）青年项目：“国优计划”高素质教师培养的模式、效果与优化策略研究，在研（主持）
④2024年度江苏省社科基金重大项目:江苏哲学社会科学学科体系建设研究，在研（子课题负责人）
③2025年江苏省高校“高质量公共课教学改革研究”专项课题：基于需求分析的新生代大学生素质教育融合课程体系创新研究，在研（联合主持）
②2024年南京大学学科交叉机制体制建设课题：“国优计划”研究生学科交叉培养机制及其成效研究，结项（主持）
①2022年顾明远教育研究发展基金项目：博士生自主研究能力的形成机制研究，结项（主持）
学术专著：
③非营利性民办学校办学模式创新研究.经济科学出版社第7作者
②中国民办教育发展报告2020-2021.教育科学出版社第4作者
①中国民办教育发展报告2019.教育科学出版社第5作者
科研奖励：
④博士生自主研究能力养成的多元路径分析——基于质性访谈与fsQCA的研究.“教育、科技、人才一体化与中国新时代研究生教育”第二届青年学者论坛（论文二等奖）
③我国高校专业管理机制现行特征及其优化的阻力分析——基于中美比较的视角.第四届研究生教育研究生论坛.（优秀论文奖）
②学术训练早期博士生学术志趣的影响因素及类型.第六届研究生教育研究生论坛.（优秀论文奖）
①美国一流大学本科专业设置与研究生专业关系初探——基于2015年卡内基分类数据库.首届全国高校高等教育学研究生学术论坛.（优秀论文一等奖）